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GitHub 星标 4.6k,Python 可视化库 Altair 入门

2020-1-17 09:38| 发布者: 炼数成金_小数| 查看: 23059| 评论: 0|来自: 量子位

摘要: 数据转化成更直观的图片,对于理解数据背后的真相很有帮助。如果你有这方面的需求,而且还在使用Python,那么强烈推荐你试一试Altair。Altair是一个专为Python编写的可视化软件包,它能让数据科学家更多地关注数据本 ...
数据转化成更直观的图片,对于理解数据背后的真相很有帮助。如果你有这方面的需求,而且还在使用Python,那么强烈推荐你试一试Altair。

Altair是一个专为Python编写的可视化软件包,它能让数据科学家更多地关注数据本身和其内在的联系。

Altair由华盛顿大学的数据科学家Jake Vanderplas编写,目前在GitHub上已经收获超过3000星。

最近,Medium上一位小姐姐Parul Pandey分享了Altair的入门教程,希望对从事数据科学的用户有帮助。

使用教程
Parul以汽车数据为例,将一个汽车数据集“cars”载入到Altair中。
cars中包含汽车的生产年份、耗油量、原产国等9个方面的数据,后面将对这些内容进行可视化处理。

安装和导入Altair软件包
除了安装Altair和它的依赖软件外,还需要安装其他前端工具,比如Jupyter Notebook、JupyterLab、Colab等等。

Parul小姐姐推荐安装JupyterLab:
$ pip install -U altair vega_datasets jupyterlab

需要注意的是,由于Altair的教程文档中还包含vega数据集,因此也需要一并安装上。

接着在终端中输入:jupyter lab,就能在你的浏览器中自动打开它啦。

在代码开头别忘了导入Altair:
import altair as alt
完成以上准备工作,我们就可以开始绘图了

开始绘制图表
Altair中的基本对象是Chart,它将数据框作为单个参数。你可以这样定义它:
chart = alt.Chart(cars)

Chart有三个基本方法:数据(data)、标记(mark)和编码(encode),使用它们的格式如下:
alt.Chart(data).mark_point().encode(
encoding_1='column_1',
encoding_2='column_2',
# etc.
)

数据顾名思义,直接导入cars数据集即可。标记和编码则决定着绘制图表的样式,下面着重介绍这两部分。

标记可以让用户在图中以不同形状来表示数据点,比如使用实心点、空心圆、方块等等。

如果我们只调用这个方法,那么所有的数据点都将重叠在一起:

这显然是没有意义的,还需要有编码来指定图像的具体内容。常用的编码有:
x: x轴数值
y: y轴数值
color: 标记点颜色
opacity: 标记点的透明度
shape: 标记点的形状
size: 标记点的大小
row: 按行分列图片
column: 按列分列图片

以汽车的耗油量为例,把所有汽车的数据绘制成一个一维散点图,指定x轴为耗油量:
alt.Chart(cars).mark_point().encode(
x='Miles_per_Gallon'
)

但是使用mark_point()会让所有标记点混杂在一起,为了让图像更清晰,可以替换成棒状标记点mark_tick():

alt.Chart(cars).mark_tick().encode(
x='Miles_per_Gallon'
)

以耗油量为X轴、马力为Y轴,绘制所有汽车的分布,就得到一张二维图像:

alt.Chart(cars).mark_line().encode(
x='Miles_per_Gallon',
y='Horsepower'
)

给图表上色
前面我们已经学会了绘制二维图像,如果能给不同组的数据分配不同的颜色,就相当于给数据增加了第三个维度。

alt.Chart(cars).mark_point().encode(
x='Miles_per_Gallon',
y='Horsepower',
color='Origin'
)


上面的图中,第三个维度“原产国”是一个离散变量。
使用颜色刻度表,我们还能实现对连续变量的上色,比如在上图中加入“加速度”维度,颜色越深表示加速度越大:
alt.Chart(cars).mark_point().encode(
x='Miles_per_Gallon',
y='Horsepower',
color='Acceleration'
)

数据的分类与汇总
上面的例子中,我们使用的主要是散点图。实际上,Altair还能方便地对数据进行分类和汇总,绘制统计直方图。
相比其他绘图工具,Altair的特点在于不需要调用其他函数,而是直接在数轴上进行修改。
例如统计不同油耗区间的汽车数量,对X轴使用alt.X(),指定数据和间隔大小,对Y轴使用count()统计数量。

alt.Chart(cars).mark_bar().encode(
x=alt.X('Miles_per_Gallon', bin=alt.Bin(maxbins=30)),
y='count()'
)


为了分别表示出不同原产国汽车的油耗分布,前文提到的上色方法也能直方图中使用,这样就构成一幅分段的统计直方图:

alt.Chart(cars).mark_bar().encode(
x=alt.X('Miles_per_Gallon', bin=alt.Bin(maxbins=30)),
y='count()',
color='Origin'
)

如果你觉得上图还不够直观,那么可以用column将汽车按不同原产国分列成3张直方图:

alt.Chart(cars).mark_bar().encode(
x=alt.X('Miles_per_Gallon', bin=alt.Bin(maxbins=30)),
y='count()',
color='Origin',
column='Origin'
)

交互
除了绘制基本图像,Altair强大之处在于用户可以与图像进行交互,包括平移、缩放、选中某一块数据等操作。

在绘制图片的代码后面,调用interactive()模块,就能实现平移、缩放:

Altair还为创建交互式图像提供了一个selection的API:

在选择功能上,我们能做出一些更酷炫的高级功能,例如对选中的数据点进行统计,生成实时的直方图。

叠加多个图层
如果把前面的汽车耗油量按年度计算出平均值:

alt.Chart(cars).mark_point().encode(
x='Miles_per_Gallon',
y='Horsepower',
color='Acceleration'
)

在统计学上,我们还能定义平均值的置信区间,为了让图表更好看,可以分别列出三个不同产地汽车的耗油量平均值置信区间:

alt.Chart(cars).mark_area(opacity=0.3).encode(
x=alt.X(‘Year’, timeUnit=’year’),
y=alt.Y(‘ci0(Miles_per_Gallon)’, axis=alt.Axis(title=’Miles per Gallon’)),
y2=’ci1(Miles_per_Gallon)’,
color=’Origin’
).properties(
width=600
)


最后我们可以用图层API将平均值和置信区间两幅图叠加起来:
spread = alt.Chart(cars).mark_area(opacity=0.3).encode(
x=alt.X('Year', timeUnit='year'),
y=alt.Y('ci0(Miles_per_Gallon)', axis=alt.Axis(title='Miles per Gallon')),
y2='ci1(Miles_per_Gallon)',
color='Origin'
).properties(
width=800
)
lines = alt.Chart(cars).mark_line().encode(
x=alt.X('Year', timeUnit='year'),
y='mean(Miles_per_Gallon)',
color='Origin'
).properties(
width=800
)
spread + lines

更多内容
本文只是介绍了Altair的一些基本使用方法,远远不能涵盖它所有的功能。如果需要了解更多,请参阅GitHub页说明:
https://github.com/altair-viz/altair

教程原文:
https://medium.com/analytics-vidhya/exploratory-data-visualisation-with-altair-b8d85494795c

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